请假扣工资要根据员工实际工作的时数来决定，用人单位不能直接扣除全部工资。
一、国家法律规定
根据《劳动法》第八十二条规定，员工在法定休假日、节假日和婚丧假期间，用人单位不得扣除其工资。《工资支付暂行规定》第十条规定，员工依法享受带薪年休假、探亲假等假期，用人单位不得扣除工资。
二、请假扣工资方式
对于未享受法定节假日、带薪年休假等法定假期的员工，请假扣工资应遵循以下方式：
(1) 全勤考核：用人单位将一个月内工作天数作为全勤考核基数，员工请假天数扣除相应的全勤考核天数。如一个月有22个工作日，员工请假1天，则扣除1天的全勤考核天数。
(2) 按日工资扣除：用人单位将员工月工资除以工作天数，得出员工每天的工资额，以该工资额为基础按请假天数扣除工资。如月工资为5000元，工作天数为22天，则每天工资额为227元，请假1天扣除227元工资。
(3) 按小时工资扣除：用人单位将员工月工资除以工作小时数，得出员工每小时的工资额，以该工资额为基础按请假小时数扣除工资。如月工资为5000元，工作小时数为176小时，则每小时工资额为28元，请假1小时扣除28元工资。
三、特殊情况
以下情况在请假期间不扣工资：
(1) 病假：在医疗机构出具的证明期内，一般不超过6个月。
(2) 事假：根据用人单位规定，因事需要请假的。
(3) 职工本人结婚、直系亲属（父母、配偶、子女）结婚或逝世。
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